Σκοπός του τμήματος αυτού είναι:

• Η ορθολογική εκμετάλλευση των υπαιθρίων και στεγασμένων αποθηκευτικών χώρων και η εποπτεία των Διαχειρίσεων προσωρινής εναπόθεσης εμπορευμάτων.
• Η παραλαβή, αποθήκευση, διαχείριση και παράδοσητων κάθε είδους εμπορευμάτων (πλην εμπορευματοκιβωτίων) στους αποθηκευτικούς χώρους της ΛιμενικήςΖώνης αρμοδιότητας του Τμήματος, καθώς και η διενέργεια κάθε σχετικής με αυτά διαδικασίας.
• Η διενέργεια κάθε διαδικασίας που αφορά τα εμπορεύματα (τήρηση λογιστικής αποθήκης κ.λ.π.), που διακινούνται από το χώρο αρμοδιότητάς του και προβλέπεται από τις σχετικές τελωνειακές διατάξεις.
• Η παρακολούθηση των φορτώσεων και μεταφορτώσεων των εγχωρίων για εξαγωγή προϊόντων, που διεξάγονται στο χώρο αρμοδιότητάς του, από χερσαία ή θαλάσσια μεταφορικά μέσα.
• Ο σχηματισμός, συμπλήρωση και διεκπεραίωση φακέλων κατά δηλωτικό μεταφορικού μέσου, με τα διαχειριστικά και οικονομικά στοιχεία των διακινούμενων απότο χώρο αρμοδιότητάς του εμπορευμάτων.
• Η έκδοση χρεωστικών σημειωμάτων και η παροχή στοιχείων προς το Τμήμα Εσόδων για τη βεβαίωση και είσπραξη των πάσης φύσεως αναλογούντων δικαιωμάτων του ΟΛΠ.
• Η φοτοεκφορτωτική, διαχειριστική και οικονομική λειτουργία του συγκροτήματος των SILOS του ΟΛΠ.
• Η σύμφωνα με τον οικείο Κανονισμό κήρυξη ως αζήτητων των εμπορευμάτων που δεν παρέλαβαν οιδικαιούχοι παραλήπτες μέσα στις προβλεπόμενες προθεσμίες.
• Η μέριμνα για την προώθηση των Αζήτητων εμπορευμάτων, στο αρμόδιο Τμήμα.
• Η καθημερινή συνεργασία με τη Διεύθυνση Προγραμματισμού και Συντονισμού Φορτοεκφορτωτικών Εργασιών για την οργάνωση και σχεδίαση του συνόλουτων εργασιών του Τμήματος.